Окончив в 1981 году Ставропольский ордена Трудового Красного Знамени сельскохозяйственный институт по специальности «учёный агроном», Сергей Николаевич начал свою трудовую деятельность в отрасли с управляющего виноградарским отделением винсовхоза имени ХХIII партсъезда Благодарненского района. Он сразу зарекомендовал себя как грамотный и исполнительный специалист, и уже в 1986 году был назначен директором винсовхоза «Большевик» Благодарненского района.
В 2004 году при поддержке правительства Ставропольского края создается организация ГКУ «Ставропольвиноградпром», основной деятельностью которой является координация и развитие виноградарства и виноделия в Ставропольском крае, куда на должность директора назначается Лысенко Сергей Николаевич.
Под его руководством была проделана огромная работа по стабилизации и дальнейшему развитию отрасли в регионе. Сергей Николаевич вел активную работу на краевом уровне по увеличению производства высококачественной конкурентно-способной виноградовинодельческой продукции, популяризации ставропольских вин, модернизации и замене устаревшего оборудования заводов первичного и вторичного виноделия, по участию винодельческих организаций в выставочно-ярмарочных мероприятиях на федеральном и краевом уровнях.
За вклад в развитие виноградарства и виноделия Ставропольского края Сергей Николаевич был награждён почётной грамотой губернатора Ставропольского края, почётной грамотой Министерства сельского хозяйства Российской Федерации, значком «Отличник народного просвещения». В 2008 году награждён медалью «За заслуги перед Ставропольским краем».
